গণস্বাস্থের প্রতিষ্ঠাতা ডাঃজাফররুল্লাহ চৌধুরীর বিরুদ্ধে আশুলিয়া থানায় জনৈক মোঃআলী একটি মামলা দায়ের করেছেন।

জায়গা-দখল সহ নানা অভিযোগ দেয়া হয়েছে।এ ছাড়া আইএসপিআরের পক্ষ থেকে সেনা প্রধানকে নিয়ে মিথ্যা তথ্য দেয়ার অভিযোগে একটি জিডি করা হলে তা গোয়েন্দা পুলিশ কে তদন্তের দায়িত্ব দেয়া হয়েছে।

জানা গেছে, এই জিডিটির তদন্তের পর রাষ্ট্রদ্রহ মামলায় পরিনত হতে পারে।এর পর তার বিরুদ্ধে গ্রেফতারী পরোয়ানা জারি করে তাকে চাপে রাখতে পারে প্রশাসন।